選株選花
選擇性狀典型、純度高、生長良好的棉株作為母本株，在母本株上，選擇中部果枝上靠近主稈第一、二節位的正常花作為雜交花朵。
去雄
(1)去雄時間。適宜的去雄時間是開花前1天的下午3點左右。判斷花朵次日開放的標志是花冠已經長大，已經伸出于副萼之外。這樣的花，第二天早晨即可開放。
(2)去雄方法。棉花去雄常用的方法有徒手去雄和工具去雄兩種。
①徒手去雄。是用手將花冠和雄蕊管一起撕去，只保留雌蕊。操作時不要碰傷子房和壓破花藥。去雄后用頂端帶節的3厘米長的麥管套住柱頭，一直壓到子房上端，但麥管上端有節的部分須離開柱頭1厘米以上。套好麥管后，掛上紙牌（或塑料牌），紙牌上寫明母本名稱和去雄時間。
②工具去雄。是用剪刀剪去花冠，再用鑷子除去花藥。如有殘留花粉，可用清水洗凈。去雄后用麥管套好柱頭。并掛好紙牌（或塑料牌）。
授粉
選擇與母本花朵同時開花的父本花蕾，在開花前1天用紙袋將花蕾套好，以防止昆蟲進入花內，帶進其它花粉。
第二天上午9～10時，將父本花朵摘下，將花瓣向外翻卷，在此同時，摘下母本花中柱頭上的麥管，用父本雄蕊在母本柱頭上輕輕涂抹幾下，完成授粉工作。涂抹時，量要多些，以利受精。然后，再用麥管套好柱頭，并在牌上寫明父本名稱、授粉日期和操作者姓名。
日常管理和收獲
授粉后，應對母本植株加強整枝，并疏去過多的蕾鈴，以保證雜交鈴的正常生長發育。收獲后將雜交鈴單獨收獲、脫粒和保存。