玉米出苗后，初生根較少，吸收養分的能力弱，用速效性化肥作種肥對幼苗的生長發育有良好作用，尤其是施基肥較少的地塊。適合于作種肥的化肥很多，如：
1.氮素化肥
在基肥施用量少或土壤瘠薄的條件下，用氮素化肥作種肥有顯著的增產效果。在氮素化肥中，硝酸銨鈣、硫酸銨、氯化銨均可作種肥施用，但應注意用量。
2.磷鉀化肥
玉米幼苗期磷鉀肥充足時，對生長有良好作用，苗高、葉大、生長健壯。施用各種磷肥作種肥均有效果，速效性的過磷酸鈣和重過磷酸鈣最適合做玉米種肥，在缺鉀地區，玉米種肥中加入鉀肥是必要的，最好用氯化鉀或硫酸鉀。
3.氮磷鉀肥配合施用
氮磷鉀肥配合做種肥施用比單獨施用時肥效高。據試驗，氮肥單施作種肥平均增產4.2％；磷肥單施作種肥平均增產2.8％；氮、磷、鉀肥配合作種肥增產12.2％